主角理想中的蚁巢，就是既要有人类的设计，又符合蚂蚁施工能力的巢穴，非洲的白蚁山和米克·皮尔的建筑设计，就为主角提供了灵感。
于是，在主角指挥下，整个巢穴热火朝天的开始了改造。
大量断头路被互相打通，形成阡陌纵横的立体交通网，一些小的道路被改造成排风管，深入地下的原排水道被拓宽。
很多巢室原先也承担道路的功能，但经过改造后，所有巢室最多只有两个出入口，与道路相分离，避免出现经常需要横穿巢室才能移动的局面。这样也方便各个巢室更好的承担寝室、仓库等职能。
主角还为自己、雄蚁和蚁后在安全的深处修建了「东杨城」式样的寝宫。
整个改造工程持续了近一年之久，这是后话。