大彝族土司联合发动的大规模叛乱。他们拥兵数十万，曾围攻成都、贵阳，占据重庆，震动西南半壁江山。虽经多年征剿，其主力已被击溃，奢崇明、安邦彦亦先后授首，然其余部仍盘踞于川南、黔西北的崇山峻岭之中，倚仗地利，时降时叛，劫掠州县，成为难以根除的顽疾。平定此乱残余，关乎川黔腹地能否长治久安。
其二则为“摇黄十三家”。此乃崛起于崇祯初年的川东北巨寇，并非指一支叛军，而是由姚天动、黄龙等十三股主要头目为首的流寇武装的合称。他们活跃于四川、陕西、湖广三省交界的广袤山区，声势浩大时聚众可达十数万。其部下成分复杂，既有活不下去的破产农民、逃兵，也有积年悍匪，行事凶残，攻城掠寨，荼毒地方，使得川北、川东一带生灵涂炭，道路断绝。剿灭此獠，是打通蜀道、恢复省内秩序的关键。
此二者，一为旧患之余烬，死而不僵；一为新乱之代表，势大猖獗。皆为当前必须倾力剿抚之首恶。至于成都府那位富可敌国的蜀王，反倒可暂置其后。
孙传庭与倪元璐抵达成都、并召集文武的消息，迅速扩散至川东北的崇山峻岭之中。“摇黄十三家”的各路头目，通过其遍布各处的眼线、以及某些与山寨暗通款曲的胥吏，很快便得知了这位以剿匪凌厉着称的朝廷总督已然亲临，且带来了数万精锐京军。
消息传到摇黄十三家的老营时，各路头目反应不一，但空气中无疑弥漫起一股紧张与躁动。
首领姚天动得报后，当即摔了酒碗，狞笑道：“孙传庭？听着名头响亮！老子杀的就是朝廷的官！他敢来，这巴山蜀水便是他的埋骨地！”
另一重要头目黄龙则更为狡黠多虑。他捻着稀疏的胡须，阴沉道：“大哥切莫轻敌。孙传庭非比寻常，他在北直隶，河南的手段，你我不是没听过。此番来者不善，善者不来。硬拼恐非上策。”