，陈友谅势大，诸将惶怖。惟庸献火攻连环计，密调舟师断敌粮道，终助太祖破敌六十万军。及平张士诚，惟庸总揽粮秣，昼夜督运，三军未尝乏食。太祖抚其背叹曰：“运筹之才，萧何不及！”
洪武初，六部初立，百废待兴。惟庸领中书省，定户籍、核田亩、修刑律，创“黄册鱼鳞”之法。尝于奉天门悬十二字屏风：“吏清则国治，赋均则民安，法简则讼息”。太祖命百官日诵之，以为施政圭臬。
七年冬，天幕现，其光如练。
惟庸大悟，泣血上《废相疏》：“臣观天幕垂戒，宰辅权重实违天道。请罢中书，分权六部，天子亲总万机。”
然此议触众怒，六科给事中联名弹劾，勋旧宿将多怀怨怼。惟庸独对家人叹：“吾以残躯作薪柴，但求新政得行，死何足惜？”
八年春，太祖携孝慈皇后、懿文太子归凤阳祭陵。临行执惟庸手曰：“昔昭烈托孤孔明，今朕以大明付卿。”命其辅燕王监国。
时浙西水患，惟庸七日七夜不眠，亲绘《导淮入海图》，发十五万民夫疏浚，终解江南之困。有司奏请立碑纪功，惟庸斥曰：“代君牧民，职分而已。”
二月十四，呕血案牍间。临终前犹持朱笔批答奏章，墨迹淋漓与血痕相浸。
太祖闻讣，掷杯于地，赤足奔出，望应天方向长跪恸哭。
谕礼部曰：“文正公克勤克俭，谋国忘身，非‘文正’不足彰其德。”
遂罢中书省，设四辅官，皆以五品学士充任，永为定制。
史臣曰：文正公殁而相位绝，此诚千古未有之变局。
观其遗奏字字椎心，乃知废相非太祖寡恩，实文正公以性命谏成。
昔诸葛亮治蜀，立法垂统；文正公辅明，破旧立新。
虽天不假年，然其忠智贯日月，宜乎配享太庙，永昭臣极。